פעילות אגף הייעור בקק"ל כוללת התוויית מדיניות, מתן הנחיות מקצועיות, אספקה של כלים ואמצעים מתקדמים בעבודה וריכוז מידע בכל אחד מהתחומים הבאים:
היערכות לשינויי אקלים, ממשק יערני, אקולוגיה ושמירת המגוון הביולוגי, לחימה במדבור, שימור קרקע, תכנון ופיתוח יערני, מחקר יערני ואקולוגי, תקציב פעולות מינהלת פיתוח הקרקע (מפ"ק) והמרחבים השונים בקק"ל בכל הנוגע לייעור, השתלמויות מקצועיות בתחום הייעור והאקולוגיה, הטמעת תורת ניהול היער בישראל, ניהול מרכז הזרעים הארצי, השבחת עצי יער, מערכות מידע גיאוגרפי (ממ"ג) במפ"ק ברמה ארצית, תשתיות מיפוי, סקרים וניטור, חישה מרחוק, בריאות והגנת היער ממזיקים ומחלות, מטעים ובוסתנים, רעייה, הגנת היער משריפות.