מאגר משמרות הוא מאגר מים מטוהרים בנפח של 2.3 מיליון קו"ב, חלק ממערכת מאגרים שנבנו באזור מנשה על ידי קק"ל במהלך השנים. המים המטוהרים מגיעים למאגר ממתקן טיהור שפכים. סוללת המאגר בנויה מעפר סלע גרוס ופנים המאגר מצופה בחרסית. המאגר אטום ביריעת HDPH בעובי 1.5 מ"מ.